ترتیب چنیش کتابهای کتابخانه تخصصی ۱. علوم قرآن ۲. تفسیر شیعه ۳. تفسیر اهل سنت ۴. علوم حدیث ۵. حدیث شیعه ۶. حدیث اهل سنت ۷. رجال اهل سنت. ۸. رجال شیعه ۹. ۶- تاریخ عمومی ۱۰. تاریخ اسلام ۱۱. علوم تاریخ ۱۲. تاریخ وسیره پیامر اکرم صلی الله علیه و آله ۱۳. ۸- امام علی علیه السلام ۱۴. حضرت زهرا ۱۵. امام حسن ع ۱۶. امام حسین ع. ۱۷. امام سجادع ۱۸. امام باقر ع ۱۹. امام صادق ع ۲۰. امام کاظموع ۲۱. امام رضاع. ۲۲. -امام جوادع. ۲۳. امام هادی ع ۲۴. امام حسن عسکری ع ۲۵. امام مهدی ع ۲۶. اهل بیت ۲۷. مجموع الآثار. ۲۸. کلام شیعه . ۲۹. امامت. ۳۰. کلام اهل سنت. ۳۱. سلفیه وهابیت ۳۲. تکفیر ۳۳. تقریب مذاهب. ۳۴. فرقه ها اسلامی ۳۵. و ادیان. ۳۶. ادعیه ۳۷. اخلاق. ۳۸. لغت ۳۹. ادبیات. ۴۰. عرفان ۴۱. منطق ۴۲. فلسفه ۴۳. اصول شیعه ۴۴. اصول اهل سنت ۴۵. اصول مقارن ۴۶. فقه شیعه ۴۷. فقه اهل سنت. ۴۸. فقه مقارن